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Summary |
Top model | |||||||||||||||
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Sequence analysis |
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Secondary structure and disorder prediction [Show] |
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1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||||
Sequence | V | G | A | R | R | A | T | Y | W | A | V | L | D | T | L | V | V | G | Y | A | L | L | P | V | L | W | I | F | S | L | S | L | K | P | T | S | T | V | K | D | G | K | L | I | P | S | T | V | T | F | D | N | Y | R | G | I | F | R | G | D | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||||
Sequence | L | F | S | S | A | L | I | N | S | I | G | I | G | L | I | T | T | V | I | A | V | V | L | G | A | M | A | A | Y | A | V | A | R | L | E | F | P | G | K | R | L | L | I | G | A | A | L | L | I | T | M | F | P | S | I | S | L | V | T | P | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||||
Sequence | L | F | N | I | E | R | A | I | G | L | F | D | T | W | P | G | L | I | L | P | Y | I | T | F | A | L | P | L | A | I | Y | T | L | S | A | F | F | R | E | I | P | W | D | L | E | K | A | A | K | M | D | G | A | T | P | G | Q | A | F | R | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | |||||||||||||||||||||
Sequence | K | V | I | V | P | L | A | A | P | G | L | V | T | A | A | I | L | V | F | I | F | A | W | N | D | L | L | L | A | L | S | L | T | A | T | K | A | A | I | T | A | P | V | A | I | A | N | F | T | G | S | S | Q | F | E | E | P | T | G | S | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | A | A | G | A | I | V | I | T | I | P | I | I | V | F | V | L | I | F | Q | R | R | I | V | A | G | L | T | S | G | A | V | K | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Domain analysis [Show] |
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PDB 2r6g chain G domain 1![]() Region: 2 - 274 Phyre2
PDB 4tqv chain J![]() Region: 2 - 267 Phyre2
PDB 3fh6 chain F![]() Region: 3 - 261 Phyre2
PDB 4tqv chain I![]() Region: 3 - 265 Phyre2
PDB 2r6g chain F![]() Region: 41 - 258 Phyre2
PDB 2onk chain C domain 1![]() Region: 1 - 261 Phyre2
PDB 2onk chain C![]() Region: 1 - 261 Phyre2
PDB 2r6g chain F domain 2![]() Region: 50 - 258 Phyre2
PDB 3d31 chain C domain 1![]() Region: 6 - 260 Phyre2
PDB 3d31 chain D![]() Region: 6 - 260 Phyre2
PDB 4ymu chain C![]() Region: 49 - 265 Phyre2
PDB 3dhw chain A domain 1![]() Region: 62 - 258 Phyre2
PDB 5kbu chain A![]() Region: 64 - 186 Phyre2
PDB 2r6g chain F domain 1![]() Region: 4 - 37 Phyre2
PDB 2hx6 chain A![]() Region: 151 - 177 Phyre2
PDB 2jwa chain A![]() Region: 67 - 100 Phyre2
PDB 2ks1 chain A![]() Region: 67 - 100 Phyre2
PDB 2m8g chain X![]() Region: 152 - 175 Phyre2
PDB 4l5e chain A![]() Region: 152 - 175 Phyre2
PDB 1umq chain A![]() Region: 152 - 175 Phyre2
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Detailed template information [Hide] |
Binding site prediction |
Due to computational demand, binding site predictions are not run for batch jobs
If you want to predict binding sites, please manually submit your model of choice to 3DLigandSite
Transmembrane helix prediction |
Transmembrane helices have been predicted in your sequence to adopt the topology shown below
Phyre is now FREE for commercial users!
All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement
Please cite: The Phyre2 web portal for protein modeling, prediction and analysis. | ||||||||||||||
Kelley LA et al.. Nature Protocols 10, 845-858 (2015)[pdf] [Citation link] | ||||||||||||||
If you use the binding site predictions from 3DLigandSite, please also cite: | ||||||||||||||
3DLigandSite: predicting ligand-binding sites using similar structures. | ||||||||||||||
Wass MN, Kelley LA and Sternberg MJ Nucleic Acids Research 38, W469-73 (2010) [PubMed] | ||||||||||||||
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