Phyre 2 Results for RVBD2490c_(PE_PGRS43)_2801264

Email	mdejesus@rockefeller.edu
Description	RVBD2490c_(PE_PGRS43)_2801264_2806246
Date	Wed Aug 7 12:50:12 BST 2019
Unique Job ID	d674b45713b82c63
Sequence	MSYVIATPEM ... Download FASTA
Job Type	normal
Job Expiry

Summary

Top model

Image coloured by rainbow N → C terminus

Model dimensions (Å):

X:54.759 Y:55.853 Z:3014.589

Model (left) based on template c1ygvA_

Top template information

PDB header:structural protein/contractile protein
Chain: A: PDB Molecule:collagen i alpha 1;
PDBTitle: the structure of collagen type i. single type i collagen2 molecule: rigid refinment

Confidence and coverage

Confidence:

100.0%

Coverage:

56%

927 residues ( 56% of your sequence) have been modelled with 100.0% confidence by the single highest scoring template.

Additional confident templates have been detected (see Domain analysis) which cover other regions of your sequence.

1523 residues ( 92%) could be modelled at >90% confidence using multiple-templates.

You may wish to try resubmitting your sequence in "intensive" mode to model more of your sequence.

Warning: 95% of your sequence is predicted disordered. Disordered regions cannot be meaningfully predicted.

3D viewing

Interactive 3D view in JSmol

For other options to view your downloaded structure offline see the FAQ

Sequence analysis

Download FASTA version

Secondary structure and disorder prediction [Show]

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M S Y V I A T P E M M A T A A F D L A R I G S Q V S A A S A V A A M P T T E V V A A G A D E V S A G I A A L F S A H A Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence E Y Q A L S A Q A A A F H D Q F V H T L T A A A R W Y T A T E I A N A A A M R V V L G A V N A P T Q T L L G R P L I G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence G A H G T A P G Q P G G A G G L L F G N G G N G A A G A V G Q V G G A G G A A G L F G I G G A G G A G G A G A P G G T G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence G T G G W L A G G G G V G G M G G A G G G A G G A G G N A G L F G N G G A G G A G G A G G G A G G A G G N A G W F G H G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence G A G G V G G V G A A G A N G A T P G Q D G A A G V A G S D D G A G G D G L A G S D G G D G G A G G V G G N G G R G G W

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence L L G N G G A G G V G G V G G A G G A G A A G G A G G A G A T G I N G P A G I S A A G G D G G A G G N G G A G G N G G V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence G G A G G A G G S A G L L G Y V G R A G D G G A G G G G G L G G A P G D G G A G G N G G S W L A A G D G G A G G H G G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence P G L G G A G G A G G A S G G A G A R A G A N G L A A G N D G P V S G G N G G K G G N G A H A P V A G G H G G N G G A G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence G N G G L V G D G G A G G H G G D G A A G A G Y A D M T A I F L G S S G T P G E D G G N G G A G G A G G A G G A H A G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence G G A G G A G G N G G A G G A G G N G A H G F N A V L V S D G G N G G D G G A G G R G G D G G A G G A G G D A P A G R A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence G S Q G V G G D G G A G G A G G A P G N G G S G G R G D M A F K D G D G G A G G D G G D P G A G G K G G A G G A G A T E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence G V T G A T G A T V H S G G N G G K G G N G A D A T V A G A N G G K G G A G G N G G L V G D G G A G G D G G S G A A G A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence N G A N V G E D G A D G T L S G Q P G E G S E A N G G Q G G V G G G G A G G A G G D G G A G S S A L G S G G N G G R G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence A G Q A G G A G G A G G A G G A G G S V S G D G G P G G K G G A G G A G G A G A S G G G G G K G A S G A D S A E A V G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence A G G K G G D G G V G G V G G D G G P G G D G G A G G A A P A G Q V G S H G V G G V G G D G G L G G A G G N G G D G G H

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence G S D G G D G G D G G D P G A G G L G G L G G D S G N G T R A A S G V D A S D H G P G S G G N G G N G G N G A Q A S V A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence G G A G G N G G D G G N A G R V G D G G A G G N G G D G A A G A N G A N S G A P G S D A L A L G Q P G G N G G Q G D A G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence Q A G G A G G A G G A G G A G G S V S G D G G A G G N G G A G G N G G V G A S G G A G A R G A N G I D S I G G T G G A G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence G G G G D G G A G G V G G H G G D G G V G G A A P S G T V G S H G T G G V G G D G G L G G A G G V G G A G G N G G I G I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence T V G G A G G A G G N G G D P G A G G R G G L G G D S G N G T S A A N G V D A S K H G P L T G G D G G V G G N G A K A A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence A A G G D G G Q G G D G G N A G L F G D G G A G G D G A D G T A A E A L G G D G G A G G A G G K G G D A G D I G D G G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence G G K G G D G A H G A L G G L T V A G G N G G A G G A G G A G G A G G A F L G D G G N G G A G G Q G G A G R G G S P G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence G G G V G G H G G A G G D A G M N G G G G T G G Q G G N G A A G G A G W S P D S D L K G F D G F D G G S G G A G G D G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420 . . . . . . . . . 1430 . . . . . . . . . 1440

Sequence A G G A G G T Q T G D G G D G G A G G L G G A G G V G G N G V D G F D I N E T T G R D G G D G G D G G Y G G W G G A G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1450 . . . . . . . . . 1460 . . . . . . . . . 1470 . . . . . . . . . 1480 . . . . . . . . . 1490 . . . . . . . . . 1500

Sequence N G G A G G S A P A G E V G N R G V G G D G G D G G S G G D A G N G G L G G D G F T Y L A D F D G E P G G D G G D G G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1510 . . . . . . . . . 1520 . . . . . . . . . 1530 . . . . . . . . . 1540 . . . . . . . . . 1550 . . . . . . . . . 1560

Sequence G G W G R P G G Q G G F G S T S G A H G K A G F G A P G G D G G D G G N G G H G G D G N G S F A D A G D G G P G G N G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1570 . . . . . . . . . 1580 . . . . . . . . . 1590 . . . . . . . . . 1600 . . . . . . . . . 1610 . . . . . . . . . 1620

Sequence N G G L G G A G R D G G A P G G D G G D G G T G G S G G F G A P P P R S I G G G D G G D G G R G G D G G R G A G G L T S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1630 . . . . . . . . . 1640 . . . . . . . . . 1650 . . . . . . . . . 1660

Sequence G G V G S S G E S G G S G N G R G D P G S G G S G G E G G E G G P S I S V N V T

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered ( 95%)

Alpha helix ( 5%)

Beta strand ( 0%)

Domain analysis [Show]

Rank Aligned region

PDB 1ygv chain A

3D model

Region: 236 - 1195
Aligned: 927
Modelled: 946
Confidence: 100.0%
Identity: 28%
PDB header:structural protein/contractile protein
Chain: A: PDB Molecule:collagen i alpha 1;
PDBTitle: the structure of collagen type i. single type i collagen2 molecule: rigid refinment

Phyre2

PDB 1y0f chain B

3D model

Region: 239 - 1214
Aligned: 914
Modelled: 934
Confidence: 100.0%
Identity: 27%
PDB header:structural protein/contractile protein
Chain: B: PDB Molecule:collagen i alpha 2;
PDBTitle: the structure of collagen type i. single type i collagen2 molecule

Phyre2

PDB 3hqv chain B

3D model

Region: 129 - 1070
Aligned: 933
Modelled: 942
Confidence: 100.0%
Identity: 26%
PDB header:structural protein, contractile protein
Chain: B: PDB Molecule:collagen alpha-2(i) chain;
PDBTitle: low resolution, molecular envelope structure of type i2 collagen in situ determined by fiber diffraction. single3 type i collagen molecule, rigid body refinement

Phyre2

PDB 2g38 chain A

3D model

Region: 8 - 84
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 99.9%
Identity: 34%
PDB header:structural genomics, unknown function
Chain: A: PDB Molecule:pe family protein;
PDBTitle: a pe/ppe protein complex from mycobacterium tuberculosis

Phyre2

PDB 2g38 chain A domain 1

3D model

Region: 8 - 84
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 99.9%
Identity: 34%
Fold: Ferritin-like
Superfamily: PE/PPE dimer-like
Family: PE

Phyre2

PDB 5xfs chain A

Region: 8 - 84
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 99.9%
Identity: 49%
PDB header:protein transport
Chain: A: PDB Molecule:pe family protein pe8;
PDBTitle: crystal structure of pe8-ppe15 in complex with espg5 from m.2 tuberculosis

Phyre2

PDB 2qub chain G

3D model

Region: 1273 - 1508
Aligned: 231
Modelled: 236
Confidence: 99.1%
Identity: 15%
PDB header:hydrolase
Chain: G: PDB Molecule:extracellular lipase;
PDBTitle: crystal structure of extracellular lipase lipa from serratia2 marcescens

Phyre2

PDB 2zj6 chain A

3D model

Region: 1314 - 1581
Aligned: 260
Modelled: 268
Confidence: 98.9%
Identity: 17%
PDB header:hydrolase
Chain: A: PDB Molecule:lipase;
PDBTitle: crystal structure of d337a mutant of pseudomonas sp. mis38 lipase

Phyre2

PDB 1k7q chain A

Region: 950 - 1412
Aligned: 415
Modelled: 423
Confidence: 98.6%
Identity: 13%
PDB header:hydrolase
Chain: A: PDB Molecule:secreted protease c;
PDBTitle: prtc from erwinia chrysanthemi: e189a mutant

Phyre2

PDB 2ml3 chain A

3D model

Region: 1318 - 1491
Aligned: 165
Modelled: 174
Confidence: 98.2%
Identity: 22%
PDB header:isomerase
Chain: A: PDB Molecule:poly(beta-d-mannuronate) c5 epimerase 6;
PDBTitle: solution structure of alge6r3 subunit from the azotobacter vinelandii2 mannuronan c5-epimerase

Phyre2

PDB 1sat chain A

3D model

Region: 1269 - 1491
Aligned: 202
Modelled: 210
Confidence: 98.0%
Identity: 15%
PDB header:hydrolase (serine protease)
Chain: A: PDB Molecule:serratia protease;
PDBTitle: crystal structure of the 50 kda metallo protease from s.2 marcescens

Phyre2

PDB 1kap chain P domain 1

3D model

Region: 1246 - 1384
Aligned: 139
Modelled: 139
Confidence: 97.9%
Identity: 19%
Fold: Single-stranded right-handed beta-helix
Superfamily: beta-Roll
Family: Serralysin-like metalloprotease, C-terminal domain

Phyre2

PDB 1om8 chain A

Region: 1308 - 1450
Aligned: 143
Modelled: 143
Confidence: 97.7%
Identity: 20%
PDB header:hydrolase
Chain: A: PDB Molecule:serralysin;
PDBTitle: crystal structure of a cold adapted alkaline protease from pseudomonas2 tac ii 18, co-crystallyzed with 10 mm edta

Phyre2

PDB 2ml2 chain A

3D model

Region: 1309 - 1379
Aligned: 71
Modelled: 71
Confidence: 97.7%
Identity: 23%
PDB header:isomerase
Chain: A: PDB Molecule:poly(beta-d-mannuronate) c5 epimerase 6;
PDBTitle: solution structure of alge6r2 subunit from the azotobacter vinelandii2 mannuronan c5-epimerase

Phyre2

PDB 1k7i chain A domain 1

3D model

Region: 1308 - 1381
Aligned: 74
Modelled: 74
Confidence: 97.7%
Identity: 26%
Fold: Single-stranded right-handed beta-helix
Superfamily: beta-Roll
Family: Serralysin-like metalloprotease, C-terminal domain

Phyre2

PDB 3p4g chain D

Region: 1305 - 1542
Aligned: 238
Modelled: 238
Confidence: 97.6%
Identity: 14%
PDB header:antifreeze protein
Chain: D: PDB Molecule:antifreeze protein;
PDBTitle: x-ray crystal structure of a hyperactive, ca2+-dependent, beta-helical2 antifreeze protein from an antarctic bacterium

Phyre2

PDB 1jiw chain P

3D model

Region: 1308 - 1384
Aligned: 77
Modelled: 77
Confidence: 97.5%
Identity: 22%
PDB header:hydrolase/hyrolase inhibitor
Chain: P: PDB Molecule:alkaline metalloproteinase;
PDBTitle: crystal structure of the apr-aprin complex

Phyre2

PDB 2agm chain A

3D model

Region: 1311 - 1377
Aligned: 67
Modelled: 67
Confidence: 97.5%
Identity: 21%
PDB header:isomerase
Chain: A: PDB Molecule:poly(beta-d-mannuronate) c5 epimerase 4;
PDBTitle: solution structure of the r-module from alge4

Phyre2

PDB 1sat chain A domain 1

3D model

Region: 1350 - 1542
Aligned: 188
Modelled: 193
Confidence: 97.4%
Identity: 19%
Fold: Single-stranded right-handed beta-helix
Superfamily: beta-Roll
Family: Serralysin-like metalloprotease, C-terminal domain

Phyre2

PDB 3bog chain B

Region: 325 - 403
Aligned: 78
Modelled: 79
Confidence: 97.4%
Identity: 41%
PDB header:antifreeze protein
Chain: B: PDB Molecule:6.5 kda glycine-rich antifreeze protein;
PDBTitle: snow flea antifreeze protein quasi-racemate

Phyre2

1
c1ygvA_

2
c1y0fB_

3
c3hqvB_

4
c2g38A_

5
d2g38a1

6
c5xfsA_

7
c2qubG_

8
c2zj6A_

9
c1k7qA_

10
c2ml3A_

11
c1satA_

12
d1kapp1

13
c1om8A_

14
c2ml2A_

15
d1k7ia1

16
c3p4gD_

17
c1jiwP_

18
c2agmA_

19
d1sata1

20
c3bogB_

21

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