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Summary |
Top model | |||||||||||||||
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Sequence analysis |
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Secondary structure and disorder prediction [Show] |
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1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | |||||||||||||||||||||
Sequence | M | T | E | C | F | L | S | D | Q | E | I | R | K | L | N | R | D | L | R | I | L | I | A | A | N | G | T | L | T | R | V | L | N | I | V | A | D | D | E | V | I | V | Q | I | V | K | Q | R | I | H | D | V | S | P | K | L | S | E | F | E | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Disorder | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | |||||||||||||||||||||
Sequence | Q | L | G | Q | V | G | V | G | R | V | L | Q | R | Y | I | I | L | K | G | R | N | S | E | H | L | F | V | A | A | E | S | L | I | A | I | D | R | L | P | A | A | I | I | T | R | L | T | Q | T | N | D | P | L | G | E | V | M | A | A | S | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | |||||||||||||||||||||
Sequence | H | I | E | T | F | K | E | E | A | K | V | W | V | G | D | L | P | G | W | L | A | L | H | G | Y | Q | N | S | R | K | R | A | V | A | R | R | Y | R | V | I | S | G | G | Q | P | I | M | V | V | T | E | H | F | L | R | S | V | F | R | D | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ? | ? | ? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
. | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | P | H | E | E | P | D | R | W | Q | F | S | N | A | I | T | L | A | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ? | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disorder confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Domain analysis [Show] |
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PDB 2nwi chain A domain 1![]() Region: 14 - 178 Phyre2
PDB 1tt8 chain A![]() Region: 10 - 176 Phyre2
PDB 3f8l chain C![]() Region: 22 - 179 Phyre2
PDB 3cnv chain A domain 1![]() Region: 36 - 179 Phyre2
PDB 2p19 chain A domain 1![]() Region: 36 - 179 Phyre2
PDB 4zsi chain A![]() Region: 27 - 179 Phyre2
PDB 2ra5 chain A![]() Region: 37 - 179 Phyre2
PDB 2ra5 chain A domain 1![]() Region: 37 - 179 Phyre2
PDB 3bwg chain A domain 2![]() Region: 37 - 179 Phyre2
PDB 2ogg chain A domain 1![]() Region: 41 - 179 Phyre2
PDB 3hfi chain A![]() Region: 41 - 179 Phyre2
PDB 2fa1 chain A domain 1![]() Region: 37 - 179 Phyre2
PDB 2ikk chain A domain 1![]() Region: 40 - 179 Phyre2
PDB 2pkh chain A domain 1![]() Region: 41 - 179 Phyre2
PDB 2ooi chain A domain 1![]() Region: 37 - 179 Phyre2
PDB 3lhe chain A![]() Region: 35 - 178 Phyre2
PDB 3ddv chain A domain 1![]() Region: 41 - 179 Phyre2
PDB 3f8m chain A![]() Region: 36 - 179 Phyre2
PDB 4zs8 chain A![]() Region: 27 - 179 Phyre2
PDB 3edp chain B![]() Region: 30 - 179 Phyre2
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Detailed template information [Hide] |
Binding site prediction |
Due to computational demand, binding site predictions are not run for batch jobs
If you want to predict binding sites, please manually submit your model of choice to 3DLigandSite
Phyre is now FREE for commercial users!
All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement
Please cite: The Phyre2 web portal for protein modeling, prediction and analysis. | ||||||||||||||
Kelley LA et al.. Nature Protocols 10, 845-858 (2015)[pdf] [Citation link] | ||||||||||||||
If you use the binding site predictions from 3DLigandSite, please also cite: | ||||||||||||||
3DLigandSite: predicting ligand-binding sites using similar structures. | ||||||||||||||
Wass MN, Kelley LA and Sternberg MJ Nucleic Acids Research 38, W469-73 (2010) [PubMed] | ||||||||||||||
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